подскажите, я правильно по чату вижу, что application form можно поправить вручную, через редактор пдф, если там допущена ошибка

да, нужно

Не можно, а нужно. Или распечатать бланк с сайта и заполнить ручкой. Но! Если это Ваша ошибка (а не внесенная системой при переносе данных из электронной анкеты), и если эта ошибка в персональных или паспортных данных (первые два раздела электронной анкеты в личном кабинете), то ее увидят в ВЦ и предложат исправить электронную анкету за 15 тыс. руб.

Больше информации по визе Испании можно найти в чате Телеграм — @VisaAsk_spain