Здравствуйте, а могут быть различными номера заявки которую отслеживаешь на vfs и в отказе написано application FRA1SP… вместо FRALED…

В каком отказе?

На шенген во францию

А при чем здесь отслеживание и отказ? Вам отказали в визе?

Да отказали просто обратил внимание что два разных номера хотя речь вроде об одном application

Там может быть номер анкеты. Они отличаются от номера отслеживания

Больше информации по визе Франции можно найти в чате Телеграм — @VisaAsk_france